#TwitJC week 3 – literature searching part 2

In my previous post, I used the paper (full-text with institutional login) discussed at #TwitJC to illustrate some of the concepts we regularly cover in teaching and conducting literature searches.

Using the following three-part quesion as an example, we explored with what search terms this paper would and would not have been found.

‘Does an antifibrinolytic agent reduce mortality in trauma patients with significant haemorrhage?’

Domain: trauma patients with significant haemorrhage
Determinant: antifibrinolytic agent
Outcome: mortality

In this post, I want to focus on the use of thesaurus terms when doing a literature search. Let’s have a look which thesaurus terms are attached to this paper, taking MeSH (in PubMed) as an example.

MeSH:

Domain: wounds and injuries, hemorrhage

• wounds and injuries is a very broad  MeSH-term, encompassing, among a host of other types of injuries, various forms of trauma. There is no single MeSH-term for trauma.
• Note that while it will limit the amount of references retrieved, it is not strictly necessary to include subheadings (e.g. wounds and injuries/complications) in a MeSH-search. In fact, it can cause you to miss relevant papers that have not been assigned that particular subheading (either on purpose or by mistake).

Determinant: tranexamic acid, antifibrinolytic agents

• When the action of a drug is being discussed, both the specific drugMeSH term (here: tranexamic acid) and the appropriate pharmacological action MeSH-term (here: antifibrinolytic agents) will be assigned to the article.
• If the pharmacological action MeSH-term is searched as [Pharmacological Action] or [pa] instead of [Mesh], all substances with that particular pharmacological action will automatically be included in the search

Outcome: hemorrhage/mortality

• Mortality is used here as a subheading. To search for a subheading irrespective of the MeSH-term to which is is attached, use mortality[subheading] or mortality[sh]
• Using the MeSH-terms mortality, death or fatal outcome would not have yielded this article. In the MeSH Database, the use of each MeSH-term is explained.

A word on outcomes:
In this case, I included one the primary outcome of the study in my three-part question. Indeed, this outcome (mortality) was mentioned in both title and abstract of the article, and was ‘awarded’ a MeSH-subheading.  Often though, this is not the case with all outcome parameters, both primary and secondary.

For instance, in title and abstract of this paper, the following outcomes are decribed:
– mortality/death with the following categories: bleeding, vascular occlusion (myocardial infarction, stroke and pulmonary embolism), multiorgan failure, head injury and other
– vascular occlusive events (i.e. not necessarily fatal), blood transfusion

Some, but not all of the outcomes mentioned in title/abstract have been awarded a MeSH-term or subheading. In addition, additional outcomes (e.g. dependency) were studied that were not mentioned at all in title/abstract or MeSH-headings (Note the ‘and other’ in the abstract!). This often happens when either the outcome in question is not the main focus of the study, or when there is no significant effect of the treatment on that particular outcome…

The take-home message is that, for therapeutic questions, it can be a good idea to limit your search to domain and determinant only, and not to include the outcome(s). This will ensure that no papers are missed which contain (negative) data on an outcome, but in which that outcome is neither indexed with thesaurus terms nor mentioned in title/abstract.

#TwitJC week 3 – some thoughts on literature searching

On Sunday night, I participated in the 3rd installment of Twitter Journal Club (#TwitJC), organized by @twitjournalclub (see also their blog: twitjc.wordpress.com).

Last week and the week before, #TwitJC drew a lot of attention and the discussions were pretty hectic. This week, however, there seemed to be slightly fewer participants and the conversation was thus easier to follow. And it was a very good experience – witness these tweets:

A summary of this week’s discussion will be posted on twitjc.wordpress.com.

For now, I want to take the paper that was discussed and run with it – in a direction that’s a bit off-track. I will use it as a case study in literature searching, highlighting some of the concepts we regularly cover in teaching and conducting searches.

TEDxMaastricht – deel 2/2

– vervolg –
(hier is deel 1)

900 genodigden, 26 sprekers, 9 pruiken, 1 flash mob, minstens 3x tranen,  12 uur top!

4 april 2011 TEDxMaastricht – The Future of Health
www.tedxmaastricht.nl

Over Health2.0, de (on)mogelijkheden van nieuwe technologie en het belang van de patiënt als regisseur van zijn/haar eigen gezondheid.

– zogauw de presentaties online komen zal ik ze linken –

Session 3: HOW?

Lucien Engelen – Let’s start saving lives by crowdsourcing
Over www.aed4.eu, een interactieve kaart van beschikbare AEDs in Nederland, tot stand gekomen via crowdsourcing.  Een directe oproep aan het publiek om bij te dragen.
‘Why do many e-health projects fail? Because we don’t listen to the users‘

Wouter Bos – Is technology the answer to the rising cost of healthcare?
Technologie zal het probleem van stijgende kosten in de gezondheidszorg niet oplossen. Om economische redenen, maar ook hierom: A Biography of Cancer, door Siddhartha Mukherjee. Realistisch verhaal.
‘We should cherish the technology, but it won’t change rising healthcare costs.’

Tim Hurson – The shock of the possible
Over autofabrieken, Hamburger University en oogoperaties in India.  Over fietsen, rolstoelen en piano’s. Over hoe mensen altijd naar een oplossing blijven zoeken.
‘Look for the unexpected connection’

Pieter Kubben – From medical knowledge to practical healthcare
De WHO noemt het de ‘Know-Do Gap’ – het gat tussen wetenschappelijke literatuur en de vertaling ervan naar de praktijk. Clinical Decision Support Systems kunnen helpen om de wetenschappelijke kennis aan het bed van de patiënt te brengen. Pieter breekt ook een lans voor evidence-based medicine zoals David Sackett bedoeld heeft: scientific literature + clinical expertise + patient values.

Salmaan Sana – Introducing Compassion for Care
Over hoe een geneeskundestudent iets kwijtraakte en het toch weer terugvond. Over Karen Armstrong en het onstaan van een beweging. Over compassie (filmpje).

Session 4: Who?

David de Bronkart – e-patient Dave
Met eigen onderzoek op internet en de input die hij kreeg vanuit online communities van patiënten zorgde Dave ervoor dat hij de juiste  behandeling kreeg voor een vergevorderd stadium van kanker. Hij pleit ervoor (als het moet in een rap) dat patiënten beschikking krijgen over hun eigen gegevens, zodat ze actief kunnen meedenken over hun eigen behandeling.  Zijn variant op Tim Berners Lee: Let patients help!
‘Patient is not a third-person word’

Thomas Power – The end of organizations as we know them
De oude organisatiestructuur (gesloten, selectief en controlerend) zal steeds meer plaatsmaken voor een netwerkstructuur (open, willekeurig en ondersteunend). Wat nodig is zijn bruggenbouwers: mensen met ‘social media capital’, mensen die verbindingen kunnen leggen.
‘With a Klout-score less than 50, you won’t get an interview in Silicon Valley’

Lawrence Sherman – Turning medical education inside out and upside down
Upside down: patiëntencontact direct aan het begin van de opleiding, niet pas na de eerste 2 jaar – Let patients help! Inside out: patiënten direct betrekken bij CME-activiteiten – Let patients help!
‘How much is this 20 year old medical textbook worth? Let’s look on Ebay…’

Nicolette Mak – Purpose, perception and power
Over hoe ze na een moeilijke jeugd haar eigen bedrijf oprichtte: een koeriersdienst gerund door mensen met een ‘moeilijk lichaan’. Over haar niet-aflatende strijd met de instanties en de regels. Over haar optimisme, haar plannen, en de kracht van haar medewerkers.

Fred Lee – What if Disney ran your hospital
Over het verschil tussen service en experience als een verpleegster bloed komt prikken.
‘Compassionate care can’t be scripted’

Bas Bloem – From God to Guide
De dokter als God bovenin de hoogwerker, of samen met de dokter om de tafel. De patiënt drukt op de noodknop en de dokter luistert.

Session 5: TEDx YOU!

met o.a.:

Remco Hogendijk (a.k.a. The Devil) – The seven sins of healthcare innovation
U zult risico nemen. U zult op tijd overdragen aan anderen. U zult ook zelf geld investeren. U zult u niet gedragen alsof u God bent. U zult leren van uw fouten. U zult realistisch zijn over de mogelijkheden van nieuwe technologieën. U zult de patiënten niet vergeten.

Paul Iske – Happy hour of brilliant healthcare failures
Wie durft aan het eind van de avond zelf op het podium van TEDx te vertellen over een gemaakte fout?

Melvin Samson – Wrapping up TEDxMaastricht
Twee minuten op de klok om te bedenken welk idee je mee gaat nemen van deze dag om uit te voeren.

… wordt dus vervolgd!

.

.

.

Disclaimer: dit is mijn persoonlijke weergave van de presentaties van TEDxMaastricht. Citaten zijn mogelijk niet geheel  letterlijk weergegeven.

TEDxMaastricht – deel 1/2

900 genodigden, 26 sprekers, 9 pruiken, 1 flash mob, minstens 3x tranen,  12 uur top!

4 april 2011 TEDxMaastricht – The Future of Health
www.tedxmaastricht.nl

Over Health2.0, de (on)mogelijkheden van nieuwe technologie en het belang van de patiënt als regisseur van zijn/haar eigen gezondheid.

– zogauw de presentaties online komen zal ik ze linken –

Session 1: WHY?

Simon Sinek – You should start with why
Over de ‘split’ die onstaat in een organisatie wanneer het ‘wat’ (geld verdienen) niet meer gelijk opgaat met het ‘waarom’ (symptomen: verlies aan passie, onstaan van wantrouwen); over het belang van persoonlijk contact voor het opbouwen van vertrouwen.
‘You can’t build trust over the internet‘

Coen van Veenendaal – Just do it
Over een absurd idee dat een enorm succes werd (Alpe d’Huzes) en over een nog grootser initiatief dat daarop volgde: Understanding Life met als doel kanker geen dodelijke ziekte meer te laten zijn.
‘We have the luxury to talk about difficult things. Patients don’t’

Renger Witkamp – Health: the ability to adapt to an ever changing environment
Over gezondheid vs. ziekte; en de beloften van een systemische aanpak: kijken naar het totaalplaatje van o.a. biologie, genetica, psychologie, voeding voor het beinvloeden van gezondheid en ziekte.
‘Health care should not be just disease management’

Luciano Fiordi – The fourth technological revolution
De vierde technologische revolutie (informatietechnologie) gaat niet over wat er allemaal mogelijk is (‘this iPhone is so cool’) maar over wat dat zegt over onszelf. We zijn ‘inforgs’, informational organisms.
In de gezondheidszorg: we kunnenin toenemende mate  informatie delen over onze gezondheid en gebruik maken van de informatie van anderen.
‘You are not alone’

Luuk Simons – From disease management to lifestyle management
Ons gedrag heeft een veel grotere invloed (75%) op onze gezondheid dan onze genen (25%) – het beïnvloeden van gedrag heeft potentieel dus een enorme invloed (ook financieel), en mensen zijn wel degelijk bereid hun gedrag te veranderen. De TUDelft werkt met een gezondheidsbevorderend programma voor haar medewerkers, waaraan nu ook de Radbouduniversiteit Nijmegen en KPN gaan meedoen.
‘Our children will get sick sooner, die sooner and in their healthy lifespan they will have to work really hard to pay for healthcare’

Session 2: WHAT?

Sophie van der Stap – Girl with the nine wigs
Gepolijste voordracht over de kracht van het even kunnen aannemen van een andere persoonlijkheid tijdens de loodzware behandelingen – haar ‘cancer holidays’.

Wolter Mooi – Guiding current routines of future doctors
Over medisch onderwijs waarbij studenten elkaars vragen beantwoorden en de docent zorgt voor inspiratie en betekenis. Analoog aan de geinformeerde, actieve, participerende patient in Health 2.0 dus ook de geïnformeerde, actieve en participerende student.
‘Small changes in routine can bring about big changes in practice’

Frans Hiddema – The least used resource: patient
Over het belang van veiligheid en het reduceren van angst bij patiënten; over het gebruik van vliegstimulatoren om OK-teams beter te leren samenwerken; over het actief betrekken van de patiënt bij de behandeling (vb: geef de patiënt een checklist zodat hij zelf kan nagaan of de behandelaars alle vereiste handelingen verrichten).
‘Nurses are the best consultants’

Jan Gunnarson – Hostmanship: the art of making people feel welcome
Over hoe je een goed gastheer kunt zijn – zorg dat je gasten en collega’s zich niet alleen getolereerd voelen, maar ook echt gewaardeerd – en zorg dat je dit ook over jezelf voelt. Geweldig voorbeeld van een buschauffeur op een vliegveld die grote voldoening haalt uit zijn werk en populair is bij zijn klanten.
‘If I feel I drive a bus full of idiots, they will be waiting for me at the next stop’

Ragna Arnott-van den Berg – This is your captain speaking
Verhaal recht uit het hart over haar moeilijke revalidatie na een hersenbloeding, het onbegrip en de quick-fix mentaliteit van de artsen (slik maar pillen), de kracht die ze haalt uit haar online contacten om zelf de regie over haar revalidatie in handen te krijgen en te houden.
Erg indrukwekkend.

Daniel Kraft – What’s next in healthcare
Duizelingwekkende presentatie over de technologische mogelijkheden van de nabije toekomst – sneller, kleiner, goedkoper, beter. Hand-held echoscopie, de kunstretina, e-legs,  ‘3D organ printing’… maar ook het online delen van persoonlijke gezondheidsinformatie en het zo profiteren van data van velen (crowd sourcing).

(hier is deel 2)

.

.

.

Disclaimer: dit is mijn persoonlijke weergave van de presentaties van TEDxMaastricht. Citaten zijn mogelijk niet geheel  letterlijk weergegeven.

Cochrane Handbook – nu met PRISMA!

Het Cochrane Handbook, hét naslagwerk voor het maken van systematic reviews in het algemeen en Cochrane Systematic Reviews in het bijzonder, is vernieuwd.

In de nieuwe versie is onder andere meer aandacht voor het volgen van de richtlijnen van het PRISMA statement voor het goed rapporteren van alle relevante onderdelen van het systematic review-proces.

Hieronder valt onder andere:
– aantal artikelen dat gevonden is met de gevolgde zoekstrategie
– aantal artikelen dat bij eerste screening afgevallen is (liefst ook waarom)
– aantal artikelen waarvan de full-text bekeken is
– aantal artikelen dat na screening van full-text afgevallen is (en waarom)
– aantal artikelen dat is meegenomen in uiteindelijke analyse

Deze gegevens kunnen worden weergegeven in een flowdiagram (voorbeeld), en dat wordt nu dus standaard onderdeel van nieuwe Cochrane Reviews.

In het PRISMA statement staat overigens nog veel meer nuttige informatie over het rapporteren van het systematic review-proces, o.a. over het goed documenteren van de gevolgde zoekstrategie (Cochrane doet dit al langer). De volledige lijst is hier te zien.